Лингвофорум

Общий раздел => Наука и техника => Генетика => Тема начата: Nevik Xukxo от февраля 23, 2012, 16:47

Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Nevik Xukxo от февраля 23, 2012, 16:47
Как бы попроще растолковать разницу между ними? :donno:
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Chocolate от февраля 23, 2012, 16:49
to be are potatoes, i are have fruitcakes.
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Awwal12 от февраля 23, 2012, 16:50
Цитата: Nevik Xukxo от февраля 23, 2012, 16:47
Как бы попроще растолковать разницу между ними? :donno:
Что такое "нуклеотидное разнообразие"?  :???
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Nevik Xukxo от февраля 23, 2012, 16:51
Цитата: Awwal12 от февраля 23, 2012, 16:50
Что такое "нуклеотидное разнообразие"?  :???

Ну, есть вот: (wiki/en) Haplotype_diversity (http://en.wikipedia.org/wiki/Haplotype_diversity)
А есть вот: (wiki/en) Nucleotide_diversity (http://en.wikipedia.org/wiki/Nucleotide_diversity)

:???
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Nevik Xukxo от февраля 23, 2012, 16:54
По слухам, большое гаплотипическое разнообразие мтДНК может быть, например, в Китае.
Но нуклеотидное разнообразие мтДНК за пределами Африки, например, может быть выше у папуасов, чем в Индии. И вообще папуасские мтДНК (из всех за пределами Африки) очень нуклеотидно разнообразные вроде как. Хотя папуасов всего-то несколько миллионов человек. :o
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Awwal12 от февраля 23, 2012, 16:57
МтДНК разве вообще учитывается в нуклеотидном разнообразии?..
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Nevik Xukxo от февраля 23, 2012, 17:01
Цитата: Awwal12 от февраля 23, 2012, 16:57
МтДНК разве вообще учитывается в нуклеотидном разнообразии?..

Ну, зарегайтесь на англоязычном dna-forums и спросите. :-\
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Кассивелан от февраля 23, 2012, 19:59
Цитата: Nevik Xukxo от февраля 23, 2012, 16:47
Как бы попроще растолковать разницу между ними? :donno:
Не совсем понятен вопрос...
Нуклеотид - это в общем-то соединение, из последовательности которых и состоит спираль ДНК.
Гаплотип - совокупность аллелей; двумя гаплотипами соответствующих хромосом определяется генотип.
Как их можно сравнивать?
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Nevik Xukxo от февраля 23, 2012, 20:05
Ну, как бы которое из них важнее для поиска прародины, если предполагается, что:

1 - частота распространения гаплогруппы
2 - высокое генетическое разнообразие гаплогруппы
3 - филогеография гаплогруппы, т.е. наличие в том или ином регионе корневых линий

если все три наличествуют  - это индикатор происхождения

гаплотип важнее или нуклеотид? :???
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Awwal12 от февраля 23, 2012, 20:07
Цитата: Nevik Xukxo от февраля 23, 2012, 20:05
гаплотип важнее или нуклеотид?
Чукчо, хрен с ним, с нуклеотидным разнообразием, но что такое "нуклеотид", запомнить-то можно?.....
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Nevik Xukxo от февраля 23, 2012, 20:08
Цитата: Awwal12 от февраля 23, 2012, 20:07
Чукчо, хрен с ним, с нуклеотидным разнообразием, но что такое "нуклеотид", запомнить-то можно?.....

Ну, я понял, что нуклеотид - это не гаплотип. :(
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Кассивелан от февраля 23, 2012, 20:14
Цитироватьгаплотип важнее или нуклеотид?
Так нуклеотиды у всех одинаковые - в ДНК их всего 4 вида.
Вот разнообразие аллелей - другое дело.
(Вашими словами, гаплотип конечно).
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Nevik Xukxo от февраля 23, 2012, 20:15
Но тогда получается, что прародина в Китае? У них больше всего гаплотипов. :umnik:
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Кассивелан от февраля 23, 2012, 20:21
Наоборот. Чем больше количество гаплотипов - тем бОльшим количеством разнообразных аллелей он представлен.
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: snn от февраля 23, 2012, 20:44
Цитата: Кассивелан от февраля 23, 2012, 20:14

Так нуклеотиды у всех одинаковые - в ДНК их всего 4 вида.

А нуклеотидное разнообразие?  :what:  :)
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Nevik Xukxo от февраля 23, 2012, 20:45
Цитата: Кассивелан от февраля 23, 2012, 20:21
Наоборот. Чем больше количество гаплотипов - тем бОльшим количеством разнообразных аллелей он представлен.

Зопуталсо. Инэтики говорят на каком-то эзоповом языке... :(
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: J2a от февраля 23, 2012, 21:10
Предположим такую ситуацию:

- в 1-ом холодильнике есть 10 разных сортов йогурта и больше ничего.

- во 2-ом холодильнике есть гречневая каша, ветчина, гороховый суп, куриные яйца и молоко.

Значит, в 1-ом - выше "гаплотипное" разнообразие, а 2-ом - "нуклеотидное".
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Awwal12 от февраля 23, 2012, 21:12
Цитата: J2a от февраля 23, 2012, 21:10
Предположим такую ситуацию:

- в 1-ом холодильнике есть 10 разных сортов йогурта и больше ничего.

- во 2-ом холодильнике есть гречневая каша, ветчина, гороховый суп, куриные яйца и молоко.

Значит, в 1-ом - выше "гаплотипное" разнообразие, а 2-ом - "нуклеотидное".
Некорректно. Вот если в 1-м холодильнике 10 сортов йогурта и каша, а во втором - 1 сорт йогурта, каша, ветчина, суп, яйца и молока - то да.
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: J2a от февраля 23, 2012, 22:01
Что в лоб, что по лбу...

В деревне Ивашкино все жители принадлежат к одной из 5 материнских линий (мито ГВС1):
-16304C
-16235G, 16304C
-16304C, 16311C
-16129A, 16304C
-16086C, 16304C

В деревне Степашкино все жители принадлежат к одной из 3 материнских линий (мито ГВС1):
-16243C
-16176T, 16274A, 16343G, 16390A, 16465T
-16211T, 16223T, 16292T, 16325C
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Кассивелан от февраля 23, 2012, 22:56
ЦитироватьА нуклеотидное разнообразие?
Я, допустим, представляю себе нуклеотид, но не особо понимаю, что конкретно кроется за фразой "нуклеотидное разнообразие"...
Это вариации разной последовательности нуклеотидов в соответствующих локусах гомологичных хромосом у разных индивидов одной и той же популяции, или как?

Цитата: Nevik Xukxo от февраля 23, 2012, 20:45
Цитата: Кассивелан от февраля 23, 2012, 20:21
Наоборот. Чем больше количество гаплотипов - тем бОльшим количеством разнообразных аллелей он представлен.

Зопуталсо. Инэтики говорят на каком-то эзоповом языке... :(
По идее, так (если в генетической генеалогии под словом "гаплотип" не подразумевают нечто другое).
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: snn от февраля 23, 2012, 23:45
Цитата: Кассивелан от февраля 23, 2012, 22:56
ЦитироватьА нуклеотидное разнообразие?
Я, допустим, представляю себе нуклеотид, но не особо понимаю, что конкретно кроется за фразой "нуклеотидное разнообразие"...
Это вариации разной последовательности нуклеотидов в соответствующих локусах гомологичных хромосом у разных индивидов одной и той же популяции, или как?

вариации разной последовательности нуклеотидов...
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Кассивелан от февраля 24, 2012, 00:16
Если так, получается я дезинформировал Чукчу...
Гаплотипное "разнообразие" ближе к центру, чем нуклеотидное.
Название: Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия
Отправлено: Nevik Xukxo от февраля 24, 2012, 07:48
Цитата: J2a от февраля 23, 2012, 21:10
Предположим такую ситуацию:

- в 1-ом холодильнике есть 10 разных сортов йогурта и больше ничего.

- во 2-ом холодильнике есть гречневая каша, ветчина, гороховый суп, куриные яйца и молоко.

Значит, в 1-ом - выше "гаплотипное" разнообразие, а 2-ом - "нуклеотидное".

Ну, то есть, в первом случае "количество", а во втором - "качество"? :???