Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразия

[Nevik Xukxo]

Как бы попроще растолковать разницу между ними?

[Chocolate]

to be are potatoes, i are have fruitcakes.

[Awwal12]

Как бы попроще растолковать разницу между ними?

Что такое "нуклеотидное разнообразие"? 

[Nevik Xukxo]

Что такое "нуклеотидное разнообразие"? 

Ну, есть вот: (wiki/en) Haplotype_diversity
А есть вот: (wiki/en) Nucleotide_diversity

[Nevik Xukxo]

По слухам, большое гаплотипическое разнообразие мтДНК может быть, например, в Китае.
Но нуклеотидное разнообразие мтДНК за пределами Африки, например, может быть выше у папуасов, чем в Индии. И вообще папуасские мтДНК (из всех за пределами Африки) очень нуклеотидно разнообразные вроде как. Хотя папуасов всего-то несколько миллионов человек.

[Awwal12]

МтДНК разве вообще учитывается в нуклеотидном разнообразии?..

[Nevik Xukxo]

МтДНК разве вообще учитывается в нуклеотидном разнообразии?..

Ну, зарегайтесь на англоязычном dna-forums и спросите.

[Кассивелан]

Как бы попроще растолковать разницу между ними?

Не совсем понятен вопрос...
Нуклеотид - это в общем-то соединение, из последовательности которых и состоит спираль ДНК.
Гаплотип - совокупность аллелей; двумя гаплотипами соответствующих хромосом определяется генотип.
Как их можно сравнивать?

[Nevik Xukxo]

Ну, как бы которое из них важнее для поиска прародины, если предполагается, что:

1 - частота распространения гаплогруппы
2 - высокое генетическое разнообразие гаплогруппы
3 - филогеография гаплогруппы, т.е. наличие в том или ином регионе корневых линий

если все три наличествуют  - это индикатор происхождения

гаплотип важнее или нуклеотид?

[Awwal12]

гаплотип важнее или нуклеотид?

Чукчо, хрен с ним, с нуклеотидным разнообразием, но что такое "нуклеотид", запомнить-то можно?.....

[Nevik Xukxo]

Чукчо, хрен с ним, с нуклеотидным разнообразием, но что такое "нуклеотид", запомнить-то можно?.....

Ну, я понял, что нуклеотид - это не гаплотип.

[Кассивелан]

гаплотип важнее или нуклеотид?

Так нуклеотиды у всех одинаковые - в ДНК их всего 4 вида.
Вот разнообразие аллелей - другое дело.
(Вашими словами, гаплотип конечно).

[Nevik Xukxo]

Но тогда получается, что прародина в Китае? У них больше всего гаплотипов.

[Кассивелан]

Наоборот. Чем больше количество гаплотипов - тем бОльшим количеством разнообразных аллелей он представлен.

[snn]

Так нуклеотиды у всех одинаковые - в ДНК их всего 4 вида.

А нуклеотидное разнообразие?   

[Nevik Xukxo]

Наоборот. Чем больше количество гаплотипов - тем бОльшим количеством разнообразных аллелей он представлен.

Зопуталсо. Инэтики говорят на каком-то эзоповом языке...

[J2a]

Предположим такую ситуацию:

- в 1-ом холодильнике есть 10 разных сортов йогурта и больше ничего.

- во 2-ом холодильнике есть гречневая каша, ветчина, гороховый суп, куриные яйца и молоко.

Значит, в 1-ом - выше "гаплотипное" разнообразие, а 2-ом - "нуклеотидное".

[Awwal12]

Предположим такую ситуацию:

- в 1-ом холодильнике есть 10 разных сортов йогурта и больше ничего.

- во 2-ом холодильнике есть гречневая каша, ветчина, гороховый суп, куриные яйца и молоко.

Значит, в 1-ом - выше "гаплотипное" разнообразие, а 2-ом - "нуклеотидное".

Некорректно. Вот если в 1-м холодильнике 10 сортов йогурта и каша, а во втором - 1 сорт йогурта, каша, ветчина, суп, яйца и молока - то да.

[J2a]

Что в лоб, что по лбу...

В деревне Ивашкино все жители принадлежат к одной из 5 материнских линий (мито ГВС1):
-16304C
-16235G, 16304C
-16304C, 16311C
-16129A, 16304C
-16086C, 16304C

В деревне Степашкино все жители принадлежат к одной из 3 материнских линий (мито ГВС1):
-16243C
-16176T, 16274A, 16343G, 16390A, 16465T
-16211T, 16223T, 16292T, 16325C

[Кассивелан]

А нуклеотидное разнообразие?

Я, допустим, представляю себе нуклеотид, но не особо понимаю, что конкретно кроется за фразой "нуклеотидное разнообразие"...
Это вариации разной последовательности нуклеотидов в соответствующих локусах гомологичных хромосом у разных индивидов одной и той же популяции, или как?

Наоборот. Чем больше количество гаплотипов - тем бОльшим количеством разнообразных аллелей он представлен.

Зопуталсо. Инэтики говорят на каком-то эзоповом языке...

По идее, так (если в генетической генеалогии под словом "гаплотип" не подразумевают нечто другое).

[snn]

А нуклеотидное разнообразие?

Я, допустим, представляю себе нуклеотид, но не особо понимаю, что конкретно кроется за фразой "нуклеотидное разнообразие"...
Это вариации разной последовательности нуклеотидов в соответствующих локусах гомологичных хромосом у разных индивидов одной и той же популяции, или как?

вариации разной последовательности нуклеотидов...

[Кассивелан]

Если так, получается я дезинформировал Чукчу...
Гаплотипное "разнообразие" ближе к центру, чем нуклеотидное.

[Nevik Xukxo]

Предположим такую ситуацию:

- в 1-ом холодильнике есть 10 разных сортов йогурта и больше ничего.

- во 2-ом холодильнике есть гречневая каша, ветчина, гороховый суп, куриные яйца и молоко.

Значит, в 1-ом - выше "гаплотипное" разнообразие, а 2-ом - "нуклеотидное".

Ну, то есть, в первом случае "количество", а во втором - "качество"?