Author Topic: Гаплогруппы в X-хромосоме?  (Read 624 times)

0 Members and 1 Guest are viewing this topic.

Offline Nevik Xukxo

  • Posts: 45863
  • Gender: Male
Неужто гаплогруппы бывают не только в митохондрии и Y-хромосоме, но и в X-хромосоме?
http://haplogroup.org/sources/signatures-of-human-european-palaeolithic-expansion-shown-by-resequencing-of-non-recombining-x-chromosome-segments/
Quote
Human genetic diversity in Europe has been extensively studied using uniparentally inherited sequences (mitochondrial DNA (mtDNA) and the Y chromosome), which reveal very different patterns indicating sex-specific demographic histories. The X chromosome, haploid in males and inherited twice as often from mothers as from fathers, could provide insights into past female behaviours, but has not been extensively investigated. Here, we use HapMap single-nucleotide polymorphism data to identify genome-wide segments of the X chromosome in which recombination is historically absent and mutations are likely to be the only source of genetic variation, referring to these as phylogeographically informative haplotypes on autosomes and X chromosome (PHAXs). Three such sequences on the X chromosome spanning a total of ~49 kb were resequenced in 240 males from Europe, the Middle East and Africa at an average coverage of 181 ×. These PHAXs were confirmed to be essentially non‐recombining across European samples. All three loci show highly homogeneous patterns across Europe and are highly differentiated from the African sample. Star-like structures of European-specific haplotypes in median-joining networks indicate past population expansions. Bayesian skyline plots and time-to-most-recent-common-ancestor estimates suggest expansions pre-dating the Neolithic transition, a finding that is more compatible with data on mtDNA than the Y chromosome, and with the female bias of X-chromosomal inheritance. This study demonstrates the potential of the use of X-chromosomal haplotype blocks, and the utility of the accurate ascertainment of rare variants for inferring human demographic history.
Не очень понял, но вроде похоже на гаплогруппы? В X-хромосоме??? :what:

Offline Toman

  • Posts: 9192
  • Gender: Male
Да в любой хромосоме. Когда интересует не очень большая глубина по времени/поколениям, так вообще любые произвольно взятые короткие участки подойдут, т.к. рекомбинация в них событие не столь уж частое (а потом можно сопоставлять картины, получаемые по куче таких разных участков, чтобы убрать глюки в тех случаях, где у кого-то рекомбинация таки имела место). Но если интересует большая глубина, по произвольным кускам уже как бы таких "глюков" будет сопоставимо с "не глюками", и трудно было бы составить общую картину. Вот они и решили найти такие участки, где рекомбинация происходит очень редко. Но в данном случае размах как-то даже несерьёзен по меркам нашего времени. Три участка общей длиной 49 кил, 240 человек... Это же очень мало. Надо бы гораздо больше, чтобы результаты были надёжными. Так что это, видимо, пока пробный вариант.
Во́зле до́ма хо́лм с куля́ми - вы́йду на́ холм, ку́ль поставлю.

 

With Quick-Reply you can write a post when viewing a topic without loading a new page. You can still use bulletin board code and smileys as you would in a normal post.

Note: this post will not display until it's been approved by a moderator.
Name: Email:
Verification:
Type the letters shown in the picture
Listen to the letters / Request another image
Type the letters shown in the picture:
√49 Напишите ответ строчными буквами:
«Сто одёжек, все без застёжек» — что это?: