В русском не могут договориться насчёт И и Ы, одна это фонема или две разные.
Бить - быть. Мило - мыло. Сито - сыто. 
В русском [ы] не бывает после мягких, а [и] — после твёрдых. Но, в отличие от других пар «твёрдых»/«мягких» гласных, в начальном положении выступает не [ы], а [и]. Конечно, это ещё не повод, считать [ы] отдельной фонемой. Однако есть вот такое нарушение системного соотношения, а также традиция произношения самостоятельного [ы] в русском даёт основание для того, чтобы разделять их по разным фонемам (другие аллофоны носители языка в самостоятельной позиции произнести не могут).

Записан
«Вот интересно, каких лингвистических жемчуг можно найти в море отодвинутых книг», Ян Гавлиш.
«Впредь прошу помнить, что придумал игру не для любых ассоциаций, а для семантически оправданных. Например, чтó это такое: „рулетке“ — „выпечке“?? Тем более, что сей ляпсус я сам совершил…», Марбол
«Ветхий Завет написан на иврите и частично на армейском», Vesle Anne
«МЛ(ять)КО … ПЛ(ять)NЪ», Тася
«Вот откроет этот спойлер, например, Марго, ничего не подозревая, а потом будут по всему форуму блюющие смайлики…», Авал
«Томан приличный мужчина. Правда по патриархальным меркам слегка голодранец», Vesle Anne
«Возможен ли фонетический переход "ж" в "п с придыханием"», forest