Лингвофорум

Общий раздел => Наука и техника => Генетика => Тема начата: Nevik Xukxo от мая 29, 2015, 22:50

Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: Nevik Xukxo от мая 29, 2015, 22:50
http://www.cell.com/ajhg/abstract/S0002-9297(15)00156-1 (http://www.cell.com/ajhg/abstract/S0002-9297%2815%2900156-1)
Tracing the Route of Modern Humans out of Africa by Using 225 Human Genome Sequences from Ethiopians and Egyptians
ЦитироватьThe predominantly African origin of all modern human populations is well established, but the route taken out of Africa is still unclear. Two alternative routes, via Egypt and Sinai or across the Bab el Mandeb strait into Arabia, have traditionally been proposed as feasible gateways in light of geographic, paleoclimatic, archaeological, and genetic evidence. Distinguishing among these alternatives has been difficult. We generated 225 whole-genome sequences (225 at 8× depth, of which 8 were increased to 30×; Illumina HiSeq 2000) from six modern Northeast African populations (100 Egyptians and five Ethiopian populations each represented by 25 individuals). West Eurasian components were masked out, and the remaining African haplotypes were compared with a panel of sub-Saharan African and non-African genomes. We showed that masked Northeast African haplotypes overall were more similar to non-African haplotypes and more frequently present outside Africa than were any sets of haplotypes derived from a West African population. Furthermore, the masked Egyptian haplotypes showed these properties more markedly than the masked Ethiopian haplotypes, pointing to Egypt as the more likely gateway in the exodus to the rest of the world. Using five Ethiopian and three Egyptian high-coverage masked genomes and the multiple sequentially Markovian coalescent (MSMC) approach, we estimated the genetic split times of Egyptians and Ethiopians from non-African populations at 55,000 and 65,000 years ago, respectively, whereas that of West Africans was estimated to be 75,000 years ago. Both the haplotype and MSMC analyses thus suggest a predominant northern route out of Africa via Egypt.
Неужели египтяне отстоят от неафриканских популяций на 55 тысяч лет? :o
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: bvs от мая 30, 2015, 21:31
Что-то не понял смысл статьи. Они вычли евразийские гаплотипы из эфиопских и египетских популяций, а остаток сравнили опять таки с евразийскими, и выходит что египетские больше похожи на евразийские? Здесь все упирается в критерий различения евразийских и африканских, по Y-гаплогруппе Е в целом до сих пор договориться не могут. Ну и не сидели они конечно 60 тыс. лет на одном месте.
Цитата: Nevik Xukxo от мая 29, 2015, 22:50
Неужели египтяне отстоят от неафриканских популяций на 55 тысяч лет? :o
Не египтяне, а их "африканская" часть генома.
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: Nevik Xukxo от мая 30, 2015, 22:54
Там ещё немного странная вещь.
Между египтянами и западными африканцами 21 тысяча лет.
Между эфиопами и западными африканцами 37 тысяч лет.
Как так вышло? За счёт высокогорья эфиопы более изолированы? :???
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: bvs от мая 30, 2015, 23:06
А как они вообще отличают исконную "африканскость" от потомков рабов исламского и античного времени? Или от нубийцев? Возможно, большее сходство из-за этого, ну и вообще субсахарцы в Египте были ближе к классическим негроидам. Кроме того, долина Нила раньше была сильно заболочена, а кругом пустыня. Какие там "исконные" популяции 60-тысячелетней давности?
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: Nevik Xukxo от мая 30, 2015, 23:09
Цитата: bvs от мая 30, 2015, 23:06
Или от нубийцев?
По крайней мере, исторически Нубия временами тесно связана с Египтом.
ЦитироватьAround 3800 BC, the second "Nubian" culture, termed the A-Group, arose.
It was a contemporary of, and ethnically and culturally very similar to, the polities in predynastic Naqada of Upper Egypt.
(wiki/en) Nubia (http://en.wikipedia.org/wiki/Nubia)
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: bvs от мая 30, 2015, 23:10
Цитата: Nevik Xukxo от мая 30, 2015, 23:09
По крайней мере, исторически Нубия временами тесно связана с Египтом.
Да не временами, там всегда были очень сильные связи.
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: Nevik Xukxo от мая 30, 2015, 23:12
Цитата: bvs от мая 30, 2015, 23:10
Да не временами, там всегда были очень сильные связи.
Ну, по крайней мере с тех пор, когда туды неолит пришёл. А раньше... :???
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: bvs от мая 30, 2015, 23:12
Интереснее было бы сравнить коптов с мусульманами, ну и жителей Верхнего Египта с Нижним.
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: Nevik Xukxo от мая 30, 2015, 23:18
Кстати, языковые нубийцы в Нубии, видимо, сравнительно позднее явление.
https://digilib.phil.muni.cz/bitstream/handle/11222.digilib/122989/SpisyFF_322-1999-1_6.pdf
(http://s016.radikal.ru/i335/1501/24/66b140703fbd.png)
Наверное, первая волна языковых нубийцев как-то связана с коллапсом бронзового века? :???
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: bvs от мая 30, 2015, 23:18
Цитата: Nevik Xukxo от мая 30, 2015, 23:12
Ну, по крайней мере с тех пор, когда туды неолит пришёл. А раньше... :???
Так и раньше негроиды по Нилу проникали далеко на Север, даже негроидные элементы Натуфийской культуры возможно из Африки. Другое дело, что донеолитическое население имело на порядки меньшую плотность, и его нельзя напрямую сравнивать даже с неолитическим, не то что с современным. Вообще общий тренд в Египте похоже был на увеличение европеоидности со временем.
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: Nevik Xukxo от мая 30, 2015, 23:22
Возможно, аборигенное население Нубии - это носители мероитского языка. :what:
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: bvs от мая 30, 2015, 23:24
Цитата: Nevik Xukxo от мая 30, 2015, 23:18
Наверное, первая волна языковых нубийцев как-то связана с коллапсом бронзового века? :???
Суданцы и нубийцы долины Нила вообще похоже эфиопиды в основном, тогда как горные нубийцы - нилотского типа. Но есть статуи египетских фараонов выраженного негроидного типа.
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: Nevik Xukxo от мая 30, 2015, 23:28
Цитата: bvs от мая 30, 2015, 23:24
Суданцы и нубийцы долины Нила вообще похоже эфиопиды в основном, тогда как горные нубийцы - нилотского типа.
Разобраться бы ещё насколько эта типология соответствует генетике. :-\
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: Nevik Xukxo от июня 9, 2015, 22:29
Цитата: bvs от мая 30, 2015, 23:12
Интереснее было бы сравнить коптов с мусульманами, ну и жителей Верхнего Египта с Нижним.
Насчёт коптов в том числе.
Вот ещё странная работка - The genetics of East African populations: a Nilo-Saharan component in the African genetic landscape
http://www.nature.com/srep/2015/150528/srep09996/full/srep09996.html
(http://www.nature.com/srep/2015/150528/srep09996//images/srep09996-f3.jpg)
Как это выходит, что нынешние египтяне сближаются с арабами Катара, а копты какие-то другие? :???
То, что на картинке просто арабы, по логике, наверное, суданские арабы? :???
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: bvs от июня 9, 2015, 22:48
Там и копты и арабы суданские. Неудивительно, что они оказались ближе к суданцам, нубийцам и эфиопам. А вообще интересно, как они вычисляют эти компоненты: Coptic (темно-зеленым) - это что? Взято у коптов, которых они исследовали, или какая-то другая выборка?
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: Nevik Xukxo от июня 9, 2015, 22:53
Цитата: bvs от июня  9, 2015, 22:48
Там и копты и арабы суданские.
суданские копты отличаются от египетских по происхождению? :???
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: bvs от июня 9, 2015, 22:59
Цитата: Nevik Xukxo от июня  9, 2015, 22:53
суданские копты отличаются от египетских по происхождению? :???
Они по идее из южного Египта, а там население более эфиопидное/субсахарское на внешность, чем в Дельте.
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: bvs от июня 9, 2015, 23:00
Вообще церковь у нубийцев и коптов общая была, так что частично могут происходить и от доарабских нубийцев.
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: Geoalex от июня 9, 2015, 23:01
Цитата: Nevik Xukxo от июня  9, 2015, 22:53
Цитата: bvs от июня  9, 2015, 22:48
Там и копты и арабы суданские.
суданские копты отличаются от египетских по происхождению? :???
Я точно не знаю, но было же до XIV века христианское гос-во на территории нынешнего Судана https://en.wikipedia.org/wiki/Kingdom_of_Makuria
Название: Tracing the Route of Modern Humans out of Africa
Отправлено: Nevik Xukxo от июня 9, 2015, 23:07
Цитата: Geoalex от июня  9, 2015, 23:01
Я точно не знаю, но было же до XIV века христианское гос-во на территории нынешнего Судана https://en.wikipedia.org/wiki/Kingdom_of_Makuria
Алодия до 1504 года была, если англовики не брешет.
Ну, да, наверное, часть коптов Судана потомки нубийцев и т. п. :??? Верю.