Есть какие-то правила или каждый пишет, как хочет?
Ну, допустим, таблица соответствий в том числе и арабской вязи есть здесь (http://www.russki-mat.net/trans.htm) (на неё ведёт ссылка со страницы арабской википедии о кириллице (http://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%A3%D8%A8%D8%AC%D8%AF%D9%8A%D8%A9_%D9%83%D9%8A%D8%B1%D9%8A%D9%84%D9%8A%D8%A9)), но каких правил придерживаются пишущие в реальности (и придерживаются ли вообще) - мне, к сожалению, неведомо.