Есть примеры когда внутренняя реконструкция ошибается, типа того, что мышь в тюркских якобы значит серун?
В реконструкции испражняться - сыч-, мышь - сыч-ган. Соответственно во всех должно быть тоже так, но не в чувашском. Почему? В алтайских эти слова отличаются, особенно в тунгусских.
И внутренняя, и внешняя реконструкции могут ошибаться. Вернее, давать несколько возможных вариантов, и оттуда исследователь выбирает то, что ему субъективно кажется вероятнее, иногда при этом ошибаясь. Но внешняя реконструкция за счет привлечения к сравнению нового материала позволяет такие случаи обнаружить и исправить, а внутренняя не позволяет, потому что там весь материал с самого начала ограничен и не допускает расширения. Поэтому, в общем, при расхождении результатов внутренней и внешней реконструкции ошибочной оказывается, как правило, внутренняя.