Гипероним для корабля, парусника и т.д.

[DarkMax2]

А, например, космический корабль, на котором боевых орудий, как правило, нет? Да, конечно, это не водное плавсредство — тем не менее, почему-то прижился именно «космический корабль», а не «космическое судно», и само возникновение такого термина указывает на «корабль» как гипероним, охватывающий и мирные суда.

Ну, это всё военный узус. Соответственно у них и не капитан корабля, а командир.