Гаплогруппы

[Agnius]

Всем известно, что из сравнения различных ДНК-последовательностей можно построить неукорененное филогенетическое дерево. И чтобы найти корень, надо например сравнить данные последовательности с какой-то внешней группой. И такой вопрос - то что гаплогруппа А является самой молодой это следует только из сравнения с гаплогруппами шимпанзе или это можно вывести сравнивая между собой только человеческие гаплогруппы?
И еще вопрос, гаплогруппы маркируют буквами латинского алфавита исходя из редких точечных мутаций. А что маркируется цифрами и маленькими буквами? Как определяется, какая точечная мутация откроет большую кладу, а какая только субкладу?

[Nevik Xukxo]

Буквы сложились исторически (надо было как-то назвать первые попавшиеся гаплогруппы), толку от них мало, гаплогруппы A вообще не существует - смотрите дерево на yfull.

[bvs]

И еще вопрос, гаплогруппы маркируют буквами латинского алфавита исходя из редких точечных мутаций. А что маркируется цифрами и маленькими буквами?

Ровно то же самое. Буквы употребляются просто для удобства. Можно записать K2b2, а можно P. Специалисты часто вообще не употребляют буквенно-цифровые обозначения, а пишут маркер мутации типа Z93 - так короче и понятнее.